MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 plasmid pUSA03

Total Repeats: 1034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007792	TA	4	8	5	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007792	TA	3	6	24	29	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007792	TCA	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007792	T	6	6	113	118	0 %	100 %	0 %	0 %	87159870
5	NC_007792	AGA	2	6	124	129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159870
6	NC_007792	T	6	6	167	172	0 %	100 %	0 %	0 %	87159870
7	NC_007792	GA	3	6	229	234	50 %	0 %	50 %	0 %	87159870
8	NC_007792	GATA	2	8	265	272	50 %	25 %	25 %	0 %	87159870
9	NC_007792	AT	3	6	284	289	50 %	50 %	0 %	0 %	87159870
10	NC_007792	A	7	7	338	344	100 %	0 %	0 %	0 %	87159870
11	NC_007792	A	6	6	356	361	100 %	0 %	0 %	0 %	87159870
12	NC_007792	A	6	6	390	395	100 %	0 %	0 %	0 %	87159870
13	NC_007792	AAAC	2	8	406	413	75 %	0 %	0 %	25 %	87159870
14	NC_007792	TTTA	2	8	423	430	25 %	75 %	0 %	0 %	87159870
15	NC_007792	ACAAG	2	10	499	508	60 %	0 %	20 %	20 %	87159870
16	NC_007792	AC	3	6	592	597	50 %	0 %	0 %	50 %	87159870
17	NC_007792	AAT	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159870
18	NC_007792	ATGA	2	8	659	666	50 %	25 %	25 %	0 %	87159870
19	NC_007792	AT	3	6	730	735	50 %	50 %	0 %	0 %	87159870
20	NC_007792	AATT	2	8	756	763	50 %	50 %	0 %	0 %	87159870
21	NC_007792	TAA	2	6	775	780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159870
22	NC_007792	GAA	2	6	791	796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159870
23	NC_007792	A	6	6	830	835	100 %	0 %	0 %	0 %	87159870
24	NC_007792	TAA	2	6	841	846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159870
25	NC_007792	AGA	2	6	871	876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159870
26	NC_007792	GAA	2	6	884	889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159870
27	NC_007792	A	6	6	929	934	100 %	0 %	0 %	0 %	87159870
28	NC_007792	GAA	2	6	992	997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159870
29	NC_007792	TAT	2	6	1009	1014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159870
30	NC_007792	GAA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159870
31	NC_007792	A	6	6	1021	1026	100 %	0 %	0 %	0 %	87159870
32	NC_007792	A	8	8	1080	1087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007792	TCT	2	6	1171	1176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007792	CTA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159858
35	NC_007792	AT	3	6	1267	1272	50 %	50 %	0 %	0 %	87159858
36	NC_007792	GTG	2	6	1291	1296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87159858
37	NC_007792	TCA	2	6	1304	1309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159858
38	NC_007792	GAA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159858
39	NC_007792	A	6	6	1377	1382	100 %	0 %	0 %	0 %	87159858
40	NC_007792	TTA	2	6	1385	1390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159858
41	NC_007792	TGA	2	6	1403	1408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159858
42	NC_007792	ACAT	2	8	1469	1476	50 %	25 %	0 %	25 %	87159858
43	NC_007792	GCA	2	6	1596	1601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87159858
44	NC_007792	AAT	2	6	1610	1615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159858
45	NC_007792	TTAAAC	2	12	1624	1635	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	87159858
46	NC_007792	AAGA	2	8	1703	1710	75 %	0 %	25 %	0 %	87159858
47	NC_007792	TA	3	6	1774	1779	50 %	50 %	0 %	0 %	87159858
48	NC_007792	CAT	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159858
49	NC_007792	AT	3	6	1869	1874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007792	T	6	6	1890	1895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007792	ATAGT	2	10	1921	1930	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007792	TA	3	6	1999	2004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007792	CTA	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007792	AGT	2	6	2025	2030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007792	TAT	2	6	2034	2039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007792	ACTTT	2	10	2041	2050	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007792	AT	3	6	2056	2061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007792	AGG	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007792	A	6	6	2228	2233	100 %	0 %	0 %	0 %	87159883
60	NC_007792	GTTTT	2	10	2262	2271	0 %	80 %	20 %	0 %	87159883
61	NC_007792	T	6	6	2268	2273	0 %	100 %	0 %	0 %	87159883
62	NC_007792	C	6	6	2281	2286	0 %	0 %	0 %	100 %	87159883
63	NC_007792	AGAA	2	8	2380	2387	75 %	0 %	25 %	0 %	87159883
64	NC_007792	A	9	9	2433	2441	100 %	0 %	0 %	0 %	87159883
65	NC_007792	A	7	7	2504	2510	100 %	0 %	0 %	0 %	87159883
66	NC_007792	TA	3	6	2585	2590	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
67	NC_007792	AAT	2	6	2600	2605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
68	NC_007792	AT	3	6	2625	2630	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
69	NC_007792	A	6	6	2645	2650	100 %	0 %	0 %	0 %	87159883
70	NC_007792	TAT	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
71	NC_007792	TGT	2	6	2761	2766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87159883
72	NC_007792	TAAA	2	8	2856	2863	75 %	25 %	0 %	0 %	87159883
73	NC_007792	ATT	2	6	2871	2876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
74	NC_007792	TAT	2	6	2900	2905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
75	NC_007792	TAAT	2	8	2922	2929	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
76	NC_007792	TAA	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
77	NC_007792	ATT	2	6	2954	2959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
78	NC_007792	TAATT	2	10	2977	2986	40 %	60 %	0 %	0 %	87159883
79	NC_007792	TCC	2	6	3001	3006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	87159883
80	NC_007792	GTT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87159883
81	NC_007792	TA	3	6	3177	3182	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
82	NC_007792	TAA	2	6	3208	3213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
83	NC_007792	ATT	2	6	3244	3249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
84	NC_007792	A	6	6	3254	3259	100 %	0 %	0 %	0 %	87159883
85	NC_007792	TA	3	6	3267	3272	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
86	NC_007792	A	6	6	3272	3277	100 %	0 %	0 %	0 %	87159883
87	NC_007792	TTG	2	6	3304	3309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87159883
88	NC_007792	AT	3	6	3329	3334	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
89	NC_007792	GGTT	2	8	3347	3354	0 %	50 %	50 %	0 %	87159883
90	NC_007792	AAC	2	6	3361	3366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159883
91	NC_007792	ATT	2	6	3383	3388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
92	NC_007792	AAT	4	12	3392	3403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
93	NC_007792	AAGG	2	8	3428	3435	50 %	0 %	50 %	0 %	87159883
94	NC_007792	AGT	2	6	3551	3556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159883
95	NC_007792	AAT	2	6	3572	3577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
96	NC_007792	TGA	2	6	3592	3597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159883
97	NC_007792	ATA	2	6	3627	3632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
98	NC_007792	AGA	2	6	3676	3681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159883
99	NC_007792	GTTTG	2	10	3692	3701	0 %	60 %	40 %	0 %	87159883
100	NC_007792	CAT	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159883
101	NC_007792	CTA	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159883
102	NC_007792	TCT	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87159883
103	NC_007792	A	7	7	3911	3917	100 %	0 %	0 %	0 %	87159883
104	NC_007792	TTA	2	6	3939	3944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
105	NC_007792	AATT	2	8	3954	3961	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
106	NC_007792	TAG	2	6	4044	4049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159883
107	NC_007792	ATA	2	6	4083	4088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
108	NC_007792	TAA	2	6	4111	4116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
109	NC_007792	TAA	2	6	4135	4140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
110	NC_007792	TAA	2	6	4200	4205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
111	NC_007792	AAT	2	6	4226	4231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
112	NC_007792	ATTA	2	8	4255	4262	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
113	NC_007792	CAATA	2	10	4273	4282	60 %	20 %	0 %	20 %	87159883
114	NC_007792	A	6	6	4343	4348	100 %	0 %	0 %	0 %	87159883
115	NC_007792	AAC	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159883
116	NC_007792	A	6	6	4425	4430	100 %	0 %	0 %	0 %	87159883
117	NC_007792	AAAG	2	8	4484	4491	75 %	0 %	25 %	0 %	87159883
118	NC_007792	TTA	2	6	4494	4499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
119	NC_007792	T	6	6	4639	4644	0 %	100 %	0 %	0 %	87159883
120	NC_007792	AAT	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
121	NC_007792	A	6	6	4684	4689	100 %	0 %	0 %	0 %	87159883
122	NC_007792	ATA	2	6	4704	4709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
123	NC_007792	TCT	2	6	4748	4753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87159883
124	NC_007792	A	7	7	4823	4829	100 %	0 %	0 %	0 %	87159883
125	NC_007792	TAA	2	6	4843	4848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
126	NC_007792	TCT	2	6	4862	4867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87159883
127	NC_007792	GAT	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159883
128	NC_007792	TAT	2	6	4953	4958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
129	NC_007792	AATT	2	8	4980	4987	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
130	NC_007792	AG	3	6	5003	5008	50 %	0 %	50 %	0 %	87159883
131	NC_007792	CAA	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159883
132	NC_007792	A	6	6	5035	5040	100 %	0 %	0 %	0 %	87159883
133	NC_007792	ATT	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
134	NC_007792	TAA	3	9	5200	5208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
135	NC_007792	TTA	2	6	5225	5230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
136	NC_007792	AAAC	2	8	5235	5242	75 %	0 %	0 %	25 %	87159883
137	NC_007792	TAG	2	6	5258	5263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007792	ATT	2	6	5319	5324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159880
139	NC_007792	A	6	6	5349	5354	100 %	0 %	0 %	0 %	87159880
140	NC_007792	ATCT	2	8	5382	5389	25 %	50 %	0 %	25 %	87159880
141	NC_007792	CAA	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159880
142	NC_007792	A	6	6	5411	5416	100 %	0 %	0 %	0 %	87159880
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144	NC_007792	T	7	7	5452	5458	0 %	100 %	0 %	0 %	87159880
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